Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gdf6P43028 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdf6P43028 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf6P43028 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms