Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv1P41164 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv1P41164 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms