Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik2P39087 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grik2P39087 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik2P39087 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik2P39087 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms