Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc5P35689 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc5P35689 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc5P35689 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc5P35689 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc5P35689 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms