Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfc1P35601 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfc1P35601 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfc1P35601 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rfc1P35601 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfc1P35601 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms