Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2aP35436 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2aP35436 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Grin2aP35436 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Grin2aP35436 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Grin2aP35436 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Grin2aP35436 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms