Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5cP35278 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5cP35278 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms