Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc3P33622 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc3P33622 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms