Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pola2P33611 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pola2P33611 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pola2P33611 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pola2P33611 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pola2P33611 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pola2P33611 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pola2P33611 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms