Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa4P31532 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms