Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc11P31313 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc11P31313 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxc11P31313 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms