Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa11P31311 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa11P31311 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms