Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd28P31041 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd28P31041 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd28P31041 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms