Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OatP29758 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OatP29758 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OatP29758 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OatP29758 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OatP29758 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OatP29758 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OatP29758 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OatP29758 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OatP29758 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OatP29758 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OatP29758 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OatP29758 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OatP29758 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OatP29758 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OatP29758 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OatP29758 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms