Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha3P29319 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha3P29319 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha3P29319 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha3P29319 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha3P29319 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha3P29319 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms