Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GrnP28798 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GrnP28798 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GrnP28798 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GrnP28798 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GrnP28798 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GrnP28798 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GrnP28798 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GrnP28798 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GrnP28798 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GrnP28798 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GrnP28798 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GrnP28798 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GrnP28798 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GrnP28798 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GrnP28798 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GrnP28798 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GrnP28798 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GrnP28798 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GrnP28798 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GrnP28798 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GrnP28798 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GrnP28798 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GrnP28798 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GrnP28798 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms