Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NapbP28663 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NapbP28663 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NapbP28663 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NapbP28663 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NapbP28663 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NapbP28663 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NapbP28663 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NapbP28663 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NapbP28663 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NapbP28663 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NapbP28663 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NapbP28663 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NapbP28663 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NapbP28663 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NapbP28663 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NapbP28663 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NapbP28663 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NapbP28663 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NapbP28663 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NapbP28663 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NapbP28663 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NapbP28663 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NapbP28663 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NapbP28663 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NapbP28663 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms