Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dusp1P28563 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dusp1P28563 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dusp1P28563 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms