Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LoxP28301 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LoxP28301 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LoxP28301 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LoxP28301 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LoxP28301 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LoxP28301 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LoxP28301 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LoxP28301 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LoxP28301 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LoxP28301 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LoxP28301 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LoxP28301 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LoxP28301 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LoxP28301 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LoxP28301 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LoxP28301 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LoxP28301 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms