Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aco1P28271 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aco1P28271 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aco1P28271 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aco1P28271 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aco1P28271 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aco1P28271 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aco1P28271 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aco1P28271 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms