Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnna1P26231 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms