Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eif3aP23116 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eif3aP23116 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms