Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RarbP22605 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RarbP22605 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RarbP22605 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RarbP22605 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RarbP22605 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RarbP22605 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RarbP22605 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RarbP22605 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RarbP22605 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RarbP22605 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RarbP22605 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RarbP22605 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RarbP22605 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RarbP22605 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RarbP22605 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RarbP22605 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RarbP22605 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RarbP22605 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RarbP22605 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RarbP22605 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RarbP22605 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RarbP22605 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RarbP22605 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RarbP22605 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RarbP22605 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RarbP22605 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RarbP22605 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RarbP22605 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RarbP22605 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RarbP22605 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RarbP22605 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RarbP22605 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RarbP22605 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RarbP22605 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms