Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gadd45bP22339 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms