Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb4P21440 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb4P21440 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb4P21440 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms