Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc2P20801 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc2P20801 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnc2P20801 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms