Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim1P20664 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim1P20664 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prim1P20664 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prim1P20664 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prim1P20664 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prim1P20664 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms