Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F3P20352 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
F3P20352 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
F3P20352 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F3P20352 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F3P20352 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
F3P20352 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
F3P20352 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
F3P20352 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F3P20352 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
F3P20352 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
F3P20352 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F3P20352 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F3P20352 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
F3P20352 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F3P20352 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F3P20352 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F3P20352 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F3P20352 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F3P20352 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F3P20352 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F3P20352 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F3P20352 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F3P20352 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F3P20352 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms