Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfaP20033 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PdgfaP20033 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms