Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps6ka3P18654 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps6ka3P18654 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms