Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptbp1P17225 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptbp1P17225 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptbp1P17225 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms