Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ass1P16460 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ass1P16460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ass1P16460 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ass1P16460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ass1P16460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ass1P16460 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ass1P16460 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms