Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb1P13372 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb1P13372 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms