Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calb1P12658 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calb1P12658 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calb1P12658 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms