Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga5P11688 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itga5P11688 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms