Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col3a1P08121 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col3a1P08121 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col3a1P08121 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms