Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Egr1P08046 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Egr1P08046 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Egr1P08046 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Egr1P08046 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms