Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna6P07350 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna6P07350 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms