Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Me1P06801 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Me1P06801 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Me1P06801 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Me1P06801 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Me1P06801 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Me1P06801 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Me1P06801 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Me1P06801 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Me1P06801 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Me1P06801 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Me1P06801 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Me1P06801 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Me1P06801 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Me1P06801 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Me1P06801 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Me1P06801 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Me1P06801 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Me1P06801 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me1P06801 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me1P06801 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me1P06801 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me1P06801 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me1P06801 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Me1P06801 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Me1P06801 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me1P06801 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me1P06801 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me1P06801 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me1P06801 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Me1P06801 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Me1P06801 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Me1P06801 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Me1P06801 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Me1P06801 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Me1P06801 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms