Protein–RNA interactions for Protein: P06684

C5, Complement C5, mousemouse

Predictions only

Length 1,680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5P06684 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5P06684 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5P06684 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5P06684 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C5P06684 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5P06684 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5P06684 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5P06684 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C5P06684 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C5P06684 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C5P06684 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C5P06684 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C5P06684 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5P06684 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5P06684 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5P06684 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5P06684 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C5P06684 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5P06684 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5P06684 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5P06684 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5P06684 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5P06684 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5P06684 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5P06684 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5P06684 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5P06684 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5P06684 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C5P06684 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C5P06684 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5P06684 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5P06684 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5P06684 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5P06684 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5P06684 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C5P06684 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5P06684 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5P06684 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5P06684 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5P06684 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C5P06684 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C5P06684 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C5P06684 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C5P06684 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5P06684 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C5P06684 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5P06684 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5P06684 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C5P06684 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C5P06684 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C5P06684 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C5P06684 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C5P06684 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C5P06684 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C5P06684 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C5P06684 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C5P06684 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C5P06684 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5P06684 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5P06684 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5P06684 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5P06684 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C5P06684 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms