Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ItgamP05555 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgamP05555 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms