Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Got1P05201 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Got1P05201 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Got1P05201 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Got1P05201 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Got1P05201 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Got1P05201 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Got1P05201 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Got1P05201 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Got1P05201 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Got1P05201 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Got1P05201 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Got1P05201 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Got1P05201 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Got1P05201 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Got1P05201 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Got1P05201 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Got1P05201 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Got1P05201 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Got1P05201 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Got1P05201 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Got1P05201 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Got1P05201 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Got1P05201 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms