Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna1P04756 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna1P04756 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna1P04756 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna1P04756 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna1P04756 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna1P04756 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms