Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04212 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04212 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04212 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04212 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04212 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04212 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04212 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04212 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04212 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04212 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms