Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxa7P02830 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxa7P02830 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms