Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01739 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01739 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01739 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01739 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01739 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01739 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01739 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01739 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01739 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01739 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01739 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01739 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01739 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01739 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01739 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01739 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01739 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01739 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01739 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01739 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms