Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01659 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01659 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01659 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01659 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01659 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01659 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01659 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01659 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01659 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms