Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01653 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01653 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01653 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01653 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01653 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01653 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01653 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01653 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01653 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01653 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
P01653 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01653 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01653 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01653 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01653 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01653 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01653 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01653 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01653 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01653 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01653 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01653 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01653 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01653 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01653 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01653 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01653 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01653 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01653 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01653 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01653 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01653 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01653 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01653 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01653 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms