Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifnb1P01575 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnb1P01575 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnb1P01575 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms