Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4bP01029 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4bP01029 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4bP01029 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4bP01029 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4bP01029 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C4bP01029 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C4bP01029 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4bP01029 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4bP01029 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C4bP01029 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4bP01029 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4bP01029 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4bP01029 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4bP01029 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C4bP01029 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C4bP01029 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4bP01029 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4bP01029 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4bP01029 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4bP01029 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C4bP01029 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C4bP01029 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C4bP01029 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4bP01029 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4bP01029 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4bP01029 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4bP01029 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C4bP01029 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4bP01029 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4bP01029 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4bP01029 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4bP01029 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4bP01029 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4bP01029 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4bP01029 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C4bP01029 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4bP01029 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4bP01029 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4bP01029 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4bP01029 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4bP01029 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C4bP01029 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
C4bP01029 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4bP01029 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms